GenoSol

La plateforme GenoSol est dédiée à l’étude de la biodiversité microbienne des sols et à l’analyse de la qualité biologique des écosystèmes terrestres. Elle développe et met en œuvre des approches de biologie moléculaire, de génomique environnementale et de bioinformatique afin de caractériser les communautés microbiennes des sols et d’évaluer l’impact des pratiques agricoles et des changements environnementaux sur leur fonctionnement.

Labélisation et démarche qualité

La plateforme GenoSol est certifiée ISO 9001 depuis septembre 2015 pour son Conservatoire des Ressources Génétiques Microbiennes. La certification ISO 9001:2015 a ensuite été étendue à l’ensemble des activités de la plateforme en septembre 2018.

En savoir plus

Activités

  • Étude de la biodiversité microbienne des sols

  • Analyse de la qualité biologique et fonctionnelle des sols

  • Caractérisation des communautés bactériennes et fongiques

  • Extraction et conservation d’ADN environnemental

  • Analyses de génomique environnementale et métagénomique

  • Développement d’outils moléculaires pour l’étude des sols

  • Traitement et analyse bioinformatique des données

  • Contribution aux observatoires et programmes de surveillance des sols

  • Appui aux projets de recherche en agroécologie et environnement

Equipements

  • Plateformes d’extraction et de purification d’ADN

  • Équipements de biologie moléculaire et de PCR

  • Outils de préparation d’échantillons pour analyses génomiques

  • Infrastructures de stockage et de conservation d’échantillons biologiques

  • Outils de séquençage et d’analyse des communautés microbiennes

  • Ressources bioinformatiques et bases de données dédiées aux sols.

Spécificités

La plateforme dispose d’une expertise reconnue dans la conservation et l’analyse de l’ADN des sols à grande échelle. Elle participe notamment à des programmes nationaux de surveillance de la biodiversité microbienne des sols et développe des méthodologies standardisées permettant le suivi à long terme des écosystèmes terrestres. Son activité associe biologie moléculaire, écologie microbienne et traitement bioinformatique des données environnementales.

Localisation

UMR Agroécologie, INRAE Dijon.

https://www2.dijon.inrae.fr/plateforme_genosol/