2B2S
Bioinformatique et Big data au Service de la Santé - Bioinformatics and Big Data for Health

La plateforme 2B2S (Bioinformatique et Big data au Service de la Santé) est une plateforme dédiée à l’analyse et à l’exploitation des données biologiques et biomédicales à haut débit. Elle accompagne les projets de recherche en santé en proposant des compétences en bioinformatique, analyse de données omiques et traitement des données issues du séquençage nouvelle génération (NGS). La plateforme intervient notamment dans les domaines de la microbiologie, de la génomique, des microbiotes et des approches multi-omiques appliquées à la santé.
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Activités
Analyse bioinformatique de données biologiques et biomédicales
Traitement de données de séquençage haut débit (NGS)
Analyses transcriptomiques RNA-seq
Analyse des microbiotes
Phylogénie microbienne
Variant calling et analyses génomiques
Analyse de données omiques en microbiologie
Traitement et interprétation de jeux de données complexes
Développement de pipelines bioinformatiques
Accompagnement méthodologique et statistique des projets de recherche
Equipements
Infrastructures de calcul et de stockage de données
Serveurs dédiés au traitement bioinformatique
Outils d’analyse de données NGS
Logiciels de bioinformatique et de biostatistiques
Environnements de traitement de données multi-omiques
Ressources de calcul pour l’analyse de big data biologiques
Spécificités
La plateforme 2B2S associe expertise en bioinformatique, biostatistiques et sciences biomédicales afin d’accompagner l’exploitation de données complexes issues des technologies de séquençage et des approches omiques. Elle intervient aussi bien sur des prestations analytiques que sur le développement méthodologique, avec une forte orientation vers les applications en santé et en microbiologie.
Localisation
La plateforme 2B2S est divisée entre l’UFR Sciences de la Santé de Université Marie et Louis Pasteur et le CHU de Besançon Franche-Comté.